为配合新线开通，广州地铁于9月17日起在鱼珠站、嘉禾望岗站车站试点启用新版线网图，全线网及列车线网图也将分批进行更换。
新版线网图分为地铁版、互联互通版两个版本。地铁版新增了13号线二期（鱼珠至天河公园）、14号线二期（乐嘉路至嘉禾望岗）地铁线路信息，与广州东环城际铁路（番禺-白云机场北）、琶莲城际铁路接驳换乘的地铁线路车站增加了城际换乘标识。互联互通版在新增地铁新线的基础上，还新增了广州东环城际（番禺-白云机场北）、琶莲城际和广惠城际（小金口-惠州北）三条城际铁路站点信息，并为其中与国铁、地铁站邻近的8个城际站点增加了换乘标识。
旅客可在城际惠州北站通过便捷通道换乘高铁站，无需二次安检；在城际竹料站、琶洲站、深井站和大石东站可实现站内换乘广州地铁14号线、11号线、7号线、3号线，在城际白云机场南站、龙洞站和科韵路站可出站换乘广州地铁3号线、6号线、5号线。
此外，新线开通后，城际线路各站点将推出“搭城际游湾区”打卡地图，帮助市民一站式了解城际沿线景点，轻松规划湾区文旅行程。