港铁表示，团队正全力推进东涌线延线项目。为配合未来东涌东站投入服务，连接该站、往香港方向的新路段已完成建造及测试，并通过相关政府部门的安全及良好审批。目前，港铁正式宣布将由9月13日起，自东涌站开出的列车将率先使用新路段行车。
东涌线列车改行新路段后，往香港方向的整体行车时间与现时大致相一致，列车班次则会维持不变。随着往香港方向路轨改道工程完成，港铁正准备展开下一阶段往东涌方向的路轨改道，包括拆除部分后续无需再行车的往香港方向路段，腾出空间铺设往东涌方向的新路轨，以及于今年底及明年分别进行第三及第四次道岔安装工序。